Het MOHO-bestand wordt geopend in Smith Micro Moho Pro 12
Omdat MOHO-bestanden animatieprojecten opslaan, zijn dit de meest bekende bestanden onder Moho-gebruikers. U kunt een MOHO-bestand maken door Bestand → Nieuw of Nieuw van sjabloon te kiezen, en het opslaan door Bestand → Opslaan of Opslaan als... te kiezen. Om een MOHO-bestand te openen, kiest u Bestand → Openen... of Recent openen.... en selecteer het MOHO-bestand.
MOHO-bestanden zijn oorspronkelijk gemaakt door vroege versies van Moho. Het bestand is echter vervangen door .ANME het bestand toen Moho Anime Studio werd. Ten slotte werd Anime Studio in versie 12 hernoemd naar Moho, dat het MOHO-bestand gebruikt om projecten op te slaan. Huidige versies van Moho ondersteunen nog steeds ANME-bestanden.