.krammen Bestandsextensie
Bestandstype Gecomprimeerd uitlijningsbestand
| De ontwikkelaar | EBI |
| Categorie | Gegevensbestanden |
| Formaat | binair |
.CRAM-optienummer
Gecomprimeerd uitlijningsbestandsformaat ontwikkeld door EBI, een buitenstation van het European Molecular Biology Laboratory; slaat korte leesuitlijningen van DNA-sequenties op die zijn gegenereerd op basis van korte leesuitlijningen zoals BWA, BBMap en BLAT.
Het CRAM-bestandsformaat is vergelijkbaar met het Binary Alignment / Map (BAM)-bestandsformaat, maar heeft een betere bestandscompressie en een geherstructureerd kolomgeoriënteerd binair containerformaat. Naarmate de gegevens op het gebied van genetische software toenemen, is het CRAM-formaat ontworpen om het afdrukken van uitlijningsgegevens op de schijf te verminderen.
Short Read Alignment is het proces waarbij wordt ontcijferd waar een sequentie vandaan komt in het genoom. Dit kan lastig zijn omdat het referentiegenoom vrij groot is en je niet altijd naar exacte matches in het referentiegenoom zoekt. Kaartleesregelaars worden gebruikt om grote reeksen te doorzoeken op overeenkomsten en overeenkomsten te sluiten. Omdat de reeksen zo groot zijn, is compressie door formaten zoals CRAM noodzakelijk om de bestandsgrootte beheersbaar te houden.
| Dakramen en raamkozijnen |
|